Ο Ολυμπιακός κληρώθηκε στον 6ο όμιλο μαζί με της Άρσεναλ(Αγγλία), Μαρσέιγ(Γαλλία) και Ντόρτμουντ(Γερμανία).Οι ερυθρόλευκοι θα αντιμετωπίσουν ξανά την ομάδα του Αρσέν Βενγκέρ όπως είχαν κάνει και πρόπερσι στην φάση των ομίλων ενώ με την Μαρσέιγ και την Ντόρτμουντ θα παίξει πρώτη φορά σε ευρωπαϊκή διοργάνωση.Η πρωταθλήτρια Γερμανίας ήταν ίσως η μόνη ομάδα που θα ήθελε να αποφύγει ο Ολυμπιακός απο το 4ο γκρούπ δυναμικότητας αλλά σε γενικές γραμμές η κλήρωση είναι βατή για τον πρωταθλητή Ελλάδας αρκεί να εκμεταλλευτεί τον παράγοντα έδρα που είναι το Στάδιο Καραϊσκάκη. Πόρτο, Σαχτάρ και Ζενίτ οι αντιπάλοι του ΑΠΟΕΛ.
Οι Ομίλοι
| ΟΜΙΛΟΣ Α | ΟΜΙΛΟΣ Β | ΟΜΙΛΟΣ C | ΟΜΙΛΟΣ D |
| Μπάγερν Μονάχου | Ίντερ Μιλάνου | Μάντσεστερ Γιουνάιτεντ | Ρεάλ Μαδρίτης |
| Βιγιαρέαλ | ΤΣΣΚΑ Μόσχας | Μπενφίκα | Λιόν |
| Μάντσεστερ Σίτυ | Λιλ | Βασιλεία | Άγιαξ |
| Νάπολι | Τραμπζοσπόρ | Οτετούλ | Ντιναμό Ζάγκρεμπ |
| OMIΛΟΣ E | ΟΜΙΛΟΣ F | ΟΜΙΛΟΣ G | ΟΜΙΛΟΣ Η |
| Τσέλσι | Άρσεναλ | Πόρτο | Μπαρτσελόνα |
| Βαλένθια | Μαρσέιγ | Σαχτάρ Ντόνετσκ | Μίλαν |
| Μπάγερ Λεβερκούζεν | ΟΛΥΜΠΙΑΚΟΣ | Ζενίτ Αγίας Πετρούπολης | Μπάτε Μπορίσοφ |
| Γκενκ | Μπορούσια Ντόρτμουντ | ΑΠΟΕΛ | Βικτόρια Πίλσεν |
