Το Αμβούργο δεν κατάφερε να βγει στην Ευρώπη και πραγματοποίησε άσχημη αγωνιστική σεζόν, με αποτέλεσμα ο Φρανκ Άρνεσεν να αποτελέσει παρελθόν.
Συνεργάστηκε με την ομάδα του Αμβούργου για δυο χρόνια από την θέση του τεχνικού διευθυντή, χωρίς ωστόσο να καταφέρει να δημιουργήσει μια ομάδα, για να πρωταγωνιστεί στην Μπουντεσλίγκα και να κυνηγά με επιτυχία, τους στόχους που είχαν τεθεί.
Αυτό είχε ως αποτέλεσμα, η διοίκηση να αποφασίσει τη λύση της συνεργασίας με τον 56χρονο, πρώην πλέον, τεχνικό διευθυντή της.
Όπως αναφέρεται, το διαζύγιο βγήκε κοινή συναινέσει.