Στη δεύτερη διαδοχική του νίκη έφτασε ο Κέσεϊ Στόνερ στο ιαπωνικό γκραν πρι στην πίστα Μοτέγκι, αφήνοντας πίσω του τον Αντρέα Ντοβιτσιόζο. Μάχη για το τρίτο σκαλί του βάθρου έδωσαν οι αναβάτες της Yamaha με τον Ρόσι τελικά να τερματίζει τρίτος.
Αναλυτικά η κατάταξη:
1. Στόνερ, Ducati, 43:12.266
2. Ντοβιτσιόζο, Repsol Honda, +3.868
3. Ρόσι, Yamaha, +5.707
4. Λορένθο, Yamaha, +6.221
5. Έντουαρντς, Monster Yamaha, +27.092
6. Σιμοντσέλι, San Carlo Honda, +30.021
7. Μπαουτίστα, Rizla Suzuki, +31.826
8. Σπις, Monster Yamaha, +35.572
9. Ντε Πουνιέτ, LCR Honda, +47.564
10. Αογιάμα, Interwetten Honda, +49.598
11. Μελάντρι, San Carlo Honda, +49.999
12. Χέιντεν, Ducati,+50.703
13. Μπαρμπερά, Paginas Amarillas, +51.422
14. Εσπαργκάρο, Pramac Racing, +52.843
15. Κάλιο, Pramac Racing, +1:14.668
Εγκατέλειψε:
1. Καπιρόσι, Rizla Suzuki
Βαθμολογία πρωταθλήματος:
1. Λορένθο, 297
2. Πεδρόσα, 228
3. Στόνερ, 180
4. Ντοβιτσιόζο, 159
5. Ρόσι, 156
6. Σπις, 139
7. Χέιντεν, 129
8. Ντε Πουνιέτ, 88
9. Σιμοντσέλι, 84
10. Έντουαρντς, 81
11. Μελάντρι, 79
12. Μπαρμπερά, 69
13. Μπαουτίστα, 58
14. Εσπαργκαρό, 52
15. Καπιρόσι, 41
16. Αογιάμα, 35
17. Κάλιο, 34
18. Ντε Άντζελις, 11